| и | в | н | п | м | о | ||
| 1 | Таксист (Уфа) | 22 | 19 | 2 | 1 | 71-14 | 59 |
| 2 | Горняк (Учалы) | 22 | 18 | 3 | 1 | 74-17 | 57 |
| 3 | Девон (Октябрьский) | 22 | 16 | 3 | 3 | 57-20 | 51 |
| 4 | ФК Ишимбай-ПНГО | 22 | 11 | 3 | 8 | 40-33 | 36 |
| 5 | Нефтехимик (Салават) | 22 | 9 | 2 | 11 | 38-43 | 29 |
| 6 | Содовик-2 (Стерлитамак) | 22 | 9 | 2 | 11 | 48-44 | 29 |
| 7 | Локомотив (Стерлитамак) | 22 | 8 | 4 | 10 | 37-35 | 25 (-3) |
| 8 | Газовик-2 (Оренбург) | 22 | 7 | 3 | 12 | 43-52 | 24 |
| 9 | Химик (Мелеуз) | 22 | 7 | 3 | 12 | 23-44 | 24 |
| 10 | Динамо (Уфа) | 22 | 6 | 3 | 13 | 29-60 | 20 (-1) |
| 11 | ФК Уфа | 22 | 3 | 3 | 16 | 33-65 | 9 (-3) |
| 12 | Рассвет (Кумертау) | 22 | 3 | 1 | 18 | 21-87 | 3 (-7) |
Первенство Башкортостана 2006 год
| и | в | н | п | м | о | ||
| 1 | Спартак (Туймазы) | ||||||
| 2 | Колос-Динамо (Давлеканово) | ||||||
| 3 | Спартак (Бирск) | ||||||
| 4 | |||||||
| 5 | |||||||
| 6 | |||||||
| 7 | |||||||
| 8 | |||||||
| 9 |
 |
